Description du poste
Le département promotion a pour mission d'assurer le montage et le suivi des études cliniques promues par le CHU de Nantes. Il assure ainsi l'obtention des accords réglementaires, le contrôle de la qualité, la gestion des bases de données, les analyses statistiques ainsi que la pharmacovigilance. Les activités de recherche en soins primaires et en soins paramédicaux sont également coordonnées par le département promotion.
La plateforme de méthodo-biostatistique (PMB) est une des cellules de ce département. Elle vise à accompagner les équipes du CHU de Nantes dans l’élaboration méthodologique de leurs études cliniques, puis dans le suivi de ces études et l’analyses des résultats. Cette plateforme regroupe plusieurs ingénieurs en statistiques et est spécialisée dans le montage d’essais interventionnels de phase précoce ou tardive. Les approches bayésiennes y sont de plus en plus utilisées.
Rattaché.e à la PMB, le/la post-doctorant/e recruté/e travaillera en étroite collaboration avec le Centre d’Investigation Clinique (CIC) du CHU de Nantes et le CR2TI de Nantes Université. Le CIC immuno-infectiologie coordonne de nombreux essais cliniques en infectiologie, réanimation et médecine d’urgence, et développe des approches d’intégration multi-omique pour identifier les mécanismes de réponse aux traitements innovants. L’équipe 6 du CR2TI, spécialisée dans les relations hôte-microbiome, étudie les réponses immunitaires aux infections pulmonaires et les mécanismes d’immunosuppression acquise après un stress inflammatoire aigu. Ses travaux reposent sur des approches translationnelles combinant cohortes de patients, modèles expérimentaux et technologies omiques de pointe afin d’améliorer la compréhension des maladies infectieuses et le développement de nouvelles stratégies thérapeutiques.
🎯 Missions principales :
SHAPe est une plateforme d’essais cliniques visant à évaluer simultanément plusieurs interventions chez des patients atteints de pneumonie sévère. Son design adaptatif repose sur un modèle statistique bayésien intégrant plusieurs randomisations et analyses intermédiaires, l’ajout de nouvelles interventions, l’utilisation éventuelle de données externes et différents types de designs.
La mission principale sera de développer et d’évaluer les méthodes bayésiennes nécessaires aux évolutions de SHAPe :
- réaliser une veille méthodologique et sélectionner les approches adaptées ;
- développer et tester les méthodes par simulations ;
- étudier l’intégration de données historiques ou externes, de stratégies phase II/III seamless, de designs PRACTICAL et d’un nombre accru de randomisations simultanées ;
- formaliser les probabilités prédictives de succès ;
- intégrer les méthodes validées et développer des programmes reproductibles pour les analyses intermédiaires.
- Un volet bioinformatique pourra compléter ces missions :
- analyse de données longitudinales de métabolomique, lipidomique, protéomique et microbiome ;
- contrôle qualité et normalisation ;
- intégration multi-omique ;
- étude des associations entre signatures biologiques et événements cliniques ;
- interprétation et valorisation des résultats.
Autres détails
Profil recherché
✅ Diplôme / Formation :
- Doctorat (ou qualification équivalente) en biostatistique ou bioinformatique.
- Un très bon niveau en langage de programmation (Python ou R) est attendu.
- Un bon niveau de connaissances en statistique bayésienne serait un plus.
Expériences attendues : Une expérience ayant permis l’acquisition d’un solide savoir-faire en bio-statistique (modélisation statistique, langages de programmation R ou Python), ou d’une bonne expertise en bioinformatique et la capacité à travailler en équipe multidisciplinaire est bienvenue. La publication d’articles dans des journaux scientifiques reconnus en tant que principal auteur sera appréciée.
✅ Compétences et qualités professionnelles associées :
- Connaissances théoriques et appliquées en statistiques bayésiennes,
- Maitrise des modélisations statistiques classiques,
- Maitrise des principes F.A.I.R., du RGPD en santé,
- Maitrise de l’anglais scientifique,
- Connaissances théoriques et appliquées en métabolomique, lipidomique protéomique et/ou microbiome. (Souhaité mais non obligatoire)
- Garantir la qualité de l’analyses de données,
- Maitrise des langages R ou Python,
- Bonne communication, transmission des résultats aux autres membres de l’équipe,
- Justification des choix,
- Respect de la confidentialité,
- Sens aigü de l’organisation,
- Prise d’initiatives,
- Rigueur scientifique,
- Relationnel respectueux et pro-actif, sens critique constructif.
Description de l'établissement
Au CHU de Nantes, nous sommes un collectif de 13 000 professionnel·le·s engagé·e·s et précurseur·euse·s, animé·e·s par la volonté de repousser les frontières de la santé. Nous portons une vision, celle de faire bouger les lignes avec tous les acteurs de santé du territoire pour améliorer la santé de tous.
Prouesse et proximité : nous assurons l’excellence des soins et de la recherche par l’approche multidisciplinaire, la culture de l’innovation et la force du compagnonnage.
Solidarité, exigence, curiosité, nos valeurs partagées guident nos actions et nous poussent à être toujours plus ingénieux, éclaireurs, activistes du soin, coopérateurs.
Nous explorons tous les possibles et sommes à la pointe de l’innovation. Nous voulons ouvrir de nouvelles voies et susciter l’espoir d‘un avenir meilleur.
Notre mission en tant que premier employeur de la région : donner les capacités d’agir aux professionnel·le·s hospitalier·ère·s.
Chacun·e de vous est essentiel·le, c’est pourquoi nous sommes engagé·e·s pour cultiver vos talents, soutenir vos engagements et faire vivre nos valeurs.
Rejoignez l’aventure !
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UN NOUVEL HOPITAL EN 2028
Situé sur la rive sud de la Loire, un nouvel hôpital verra le jour en 2028. Ce nouvel hôpital est le plus grand projet hospitalier actuellement conduit en France.
Il regroupera, sur un même site, le plateau technique du CHU, actuellement répartis sur l’Hôtel Dieu et l’Hôpital Nord Laennec (blocs, imagerie, laboratoires) et l’institut de recherche en santé (IRS 2020).
Il sera le socle du quartier de la santé, un projet de dimension européenne, qui réunira également à proximité : la faculté de santé, des écoles paramédicales, des instituts de recherche et un projet d’incubateur en santé.
Cet écosystème original composé d’enseignants, de soignants, de chercheurs et d’entrepreneurs favorisera l’innovation médicale et son transfert rapide au lit du patient.
Avec 1436 lits et places et une augmentation de lits en soins critiques (10%), le nouvel hôpital proposera 64% de séjours en ambulatoire dans un environnement plus moderne, connecté et confortable, tant pour les patients que les professionnels.