Description du poste
Depuis plus de 30 ans le CHU de Nantes conduit une politique très volontariste pour assurer le développement de la recherche biomédicale sur le site. Il compte aujourd’hui parmi les 10 CHU les plus forts chercheurs de France. Il tire notamment sa force de son écosystème : le CHU de Nantes est le seul CHU membre d’un établissement public expérimental (EPE), Nantes Université, labélisé depuis 2022 I-Site autour d’un projet ambitieux sur la santé et l’industrie du futur.
Au sein du CHU de Nantes, la Direction de la recherche et de l’innovation (DRI) du CHU de Nantes contribue activement à la mise en œuvre stratégique et opérationnelle de ces enjeux. Elle est organisée en 5 départements : Grands programmes Nationaux & Européens, Innovation & Développement, Investigation & Recherche translationnelle, Promotion, Ressources & Support.
Elle regroupe près de 520 collaborateurs, au service de la recherche et de l’innovation.
Le département grands programmes nationaux et européens est mobilisé dans le montage et le suivi de grands projets d'excellence, soutenus en particulier dans le cadre du Plan France 2030, opérés par différentes agences de financement (BPI France, ANR), et des programmes européens. A titre d'exemple, il est mobilisé dans le montage de projets de Recherche Hospitalo-Universitaire (RHU) et européens.
Le département investigation et recherche translationnelle est en charge de la conduite des études. Ce département fédère les 26 unités d'investigation clinique, dont la moitié sont labélisées Centre d'Investigation Clinique (CIC) par le ministère de la Santé et l'Inserm, en reconnaissance de leurs activités de recherche translationnelle conduites avec les laboratoires de recherche du site (9 Unités Mixtes de Recherche). Les activités des structures d'appui à la recherche tels que le Centre de Ressources Biologiques (CRB), la Tumorothèque et la Clinique Des Données (C2D) sont pilotées par ce département et se placent à l'interface avec les structures de recherche de l'écosystème nantais (UMR, université, école centrale).
Le/la chercheur.e post-doctorant.e travaillera sur le développemnt d’un modèle synthétique de l'arbre vasculaire destiné à la détection des anévrismes intracrâniens, applicable à diverses modalités d'imagerie (MRA-ToF, 3DRA, CTA).
Contexte du projet :
Dans le cadre de diverses collaborations entre le Centre Hospitalier Universitaire de Nantes (service de neuroradiologie) et l'Institut du Thorax (ITX, UMR 1087), nous étudions l'arbre vasculaire cérébral. Plus précisément, nous proposons des outils automatisés pour caractériser les artères cérébrales, classifier les bifurcations artérielles et détecter les anévrismes intracrâniens à l'aide d'approches d'apprentissage profond sur des acquisitions MRA-ToF.
Au sein du CHU de Nantes, nous recherchons donc un(e) jeune chercheur(se) (titulaire d'un doctorat) intéressé par un post-doctorat (12 mois, avec possibilité de prolongation) dans le domaine de l'imagerie médicale et de l'intelligence artificielle.
Description du poste :
Le projet porte sur la création de modèles vasculaires synthétiques spécialement conçus pour l'imagerie médicale 3D (MRA-ToF, CTA ou 3DRA) dans le domaine de la neuroradiologie. L'objectif principal de ces modèles synthétiques sera d'améliorer les performances des réseaux neuronaux dans la détection automatique des anévrismes intracrâniens.
Le/la chercheur.e post-doctorant.e sera employé.e par le Centre hospitalier universitaire de Nantes, au sein du laboratoire ITX. Il/elle s'appuiera sur un ensemble existant de modèles vasculaires synthétiques (conçus initialement sur des MRA-ToF) et proposera des versions plus spécifiquement adaptées aux acquisitions CTA et 3DRA. Les modèles synthétiques serviront à terme à l'entraînement de réseaux neuronaux profonds.
Le/La post-doc travaillera donc conjointement sur les réseaux neuronaux convolutifs et le modèle vasculaire synthétique (impliquant le traitement du signal/de l'image et la morphologie mathématique).
Un ensemble de données d'images considérable est disponible : 2 000 angiographies par résonance magnétique à temps de vol (MRA-ToF) provenant de plus de 60 hôpitaux universitaires, 1 000 angiographies par rotation 3D (3DRA) et des centaines d'angiographies par tomodensitométrie (CTA).
Autres détails
Profil recherché
Diplôme / Formation : Un doctorat en informatique, en intelligence artificielle, en traitement d'images ou en mathématiques appliquées est obligatoire.
Expériences attendues : Une expérience préalable en apprentissage profond et en traitement d'images/de signaux est requise.
Compétences associées : De solides compétences en programmation sont requises (Python obligatoire, C/C++ serait apprécié) ; De bonnes compétences en anglais (oral et écrit) sont attendues.
Qualités professionnelles associées : Faire preuve d'autonomie tout en étant capable de travailler en équipe ; faire preuve de rigueur scientifique ; être capable de travailler au sein d'un projet multidisciplinaire.
Description de l'établissement
Au CHU de Nantes, nous sommes un collectif de 13 000 professionnel·le·s engagé·e·s et précurseur·euse·s, animé·e·s par la volonté de repousser les frontières de la santé. Nous portons une vision, celle de faire bouger les lignes avec tous les acteurs de santé du territoire pour améliorer la santé de tous.
Prouesse et proximité : nous assurons l’excellence des soins et de la recherche par l’approche multidisciplinaire, la culture de l’innovation et la force du compagnonnage.
Solidarité, exigence, curiosité, nos valeurs partagées guident nos actions et nous poussent à être toujours plus ingénieux, éclaireurs, activistes du soin, coopérateurs.
Nous explorons tous les possibles et sommes à la pointe de l’innovation. Nous voulons ouvrir de nouvelles voies et susciter l’espoir d‘un avenir meilleur.
Notre mission en tant que premier employeur de la région : donner les capacités d’agir aux professionnel·le·s hospitalier·ère·s.
Chacun·e de vous est essentiel·le, c’est pourquoi nous sommes engagé·e·s pour cultiver vos talents, soutenir vos engagements et faire vivre nos valeurs.
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